机械工程及自动化是机械工程学科的重要组成部分，也是对国民经济发展起着关键作用的专业领域之一。依托核工业西南物理研究院和成都理工大学两个共建单位，我校于2000年建立，当年机械工程及自动化专业开始招生，由于办学规模的扩大，以机械工程及自动化专业为主组建了机电工程系。随着学科的发展和专业数量的增加，于2004年由机电工程系合并电子信息工程系的测控技术与仪器本科专业和电子测量技术与仪器专科专业组建自动化工程系。机械工程及自动化专业从2000年开始招生，现已招收11届学生，已有毕业生7届，目前在校生人数达1072人，累计毕业生人数为954人。

　　2005年，以市场需求和行业发展为导向，强调专业设置的应用性和针对性，机械工程及自动化专业分机电一体化、材料成型及控制工程和机械设计制造及其自动化三个方向，课程设置上采取前期趋同、后期分化的原则，在专业上更加细化，适应市场和社会的需求。

　　2005年起，3年间建立校外多个实践实习基地（成都普锐斯数控机床有限公司、四川乐山亚联机械有限公司、菲尼克斯半导体有限公司、乐山东风汽车电器有限公司、飞舸模具有限公司等），并于2009年与菲尼克斯半导体有限公司和四川乐山亚联机械有限公司签订了“订单式”培养协议，每年为两家企业培养10～20名学生，真正实现了校企供求关系的零距离对接。

　　2006年，学院组建金工实训中心，进一步加强了机械专业和部分理工科专业学生的金工实训条件。

　　2007年，学院投资200万元组建数控实训中心，其中包括1台加工中心，6台数控车床，1台数控线切割机，极大的改善了数控实训条件。

2008年，修订新的机械工程及自动化专业人才培养方案，进一步完善了“专业基础+专业方向+实践环节”的课程体系。并组织《理论力学》教学团队编写适合我院的教材。

　　2009年，随着材料成型及控制工程专业的成功申报并获教育部批准，根据市场需求，将机械工程及自动化专业的材料成型及控制工程方向调整为数控技术及应用方向，进一步适应社会对数控专业的人才需求。并组织《机械制造工艺学》教学团队编写教材并成功出版。

　　2009年学院加大对我系实验室建设的资金投入，根据我系机械专业学生人数和课程配置，扩建了金属材料实验室、液压传动实验室、机械原理演示实验室及机电传动实验室；新建了机械综合实验室，其中包括刀具、刃具、量具、模具及机械制图的综合演示，根据专业知识和新申报专业的需要，还将计划新建计算机仿真实验室、材料成型实验室和焊接技术实验室，使我系机械专业的实验室规模进一步扩大，极大地满足了学生的实践环节对实验室的需求。

　　2009年，完成《理论力学》和《机械设计基础》两门院级精品课程的建设工作并通过验收，同时积极努力时刻准备申报省级精品课程。

2009年学院投资3000万拟建省级实验教学示范中心，以现代企业经营全过程为主线，以机电模块为主、涵盖经济与管理等多个相关学科专业，构建起了较完整的实验教学体系和工程训练课程体系。

   　成功的专业建设和实验条件的改善使得我院生源从当初只针对四川省内招生发展到现在以四川省为主扩大到目前河北、山西、内蒙古、辽宁、吉林、黑龙江、江苏、浙江、安徽、福建、江西、山东、河南、湖北、湖南、广东、广西、海南、重庆、贵州、云南、陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆等全国大多数省市、自治区。招生人数从开始每届仅有50人左右发展到现在每年300人左右的稳定生源。机械工程及自动化专业在机械及相关教研室教师的共同辛勤耕耘下，积累了丰富的教学经验，制定了完善的专业培养体系、课程体系、实验体系。本专业在11年的发展过程中，始终以专业人才质量建设为核心，紧紧瞄准行业需要，适时调整专业人才培养目标，不断深化教学改革，教学观念、教学内容和教育技术不断更新。